На особо охраняемой природной территории насчитывается более 220 видов пернатых, более 30 видов внесены в Красную книгу РФ и Красноярского края. Большинство из них либо гнездятся в этой местности, но улетают осенью на зимовку, либо являются пролётными, то есть мигрируют через территорию нацпарка. Постоянно живет в заповеднике 62 вида птиц.
Развитие массового туризма в «Красноярских Столбах» сопровождается развитием инфраструктуры, в том числе созданием новых крупных объектов, таких как визит-центры или эколого-познавательные центры, музеи природы, домики для размещения туристов и т. д. Как правило такие строения имеют большие площади остекления для создания светлых помещений, что часто становится причиной гибели пернатых от столкновения с ним.
При средней скорости полета от 60 до 90 км/ч (например, для скворца, скопы), достигающей при охоте или просто игре 200 км/ч, гибель птиц при столкновении с препятствием неизбежна. А так как у разных видов птиц перелеты происходят на разных высотах, от 20 до 500 м, то даже не очень высокие здания, становятся потенциально опасными.
В «Красноярских Столбах» гибель птиц фиксируется в последние годы в месте пересечений миграционных потоков, на участке научно-познавательного комплекса Нарым, а также на участке Восточного входа, где обустроено значительное число строений с большой площадью остекления. Попытка обезопасить пернатых от гибели, а именно превентивные наклейки хищников на стекла не привели к ожидаемому результату. Птицы быстро к ним привыкают и перестают реагировать.
Для всесторонней оценки влияния остекления на численность птиц на особо охраняемой природной территории запущен исследовательский проект и уже проведены первые учеты. На основе собранной информации орнитологи планируют разработать методы защиты птиц в зависимости от их численности и особенностей пролета на отдельных участках рекреационной зоны и установить защитные устройства на основные строения.
Проект реализуется при поддержке золотодобывающей компании «Полюс» в рамках программы сохранения биоразнообразия «Заповедная территория». В 2023 году компания помогла реализовать аналогичное исследование воздействия расширения рекреационной активности в национальном парке на популяцию рыси.
